MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS2

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019434	AAAG	2	8	1797	1804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019434	TTTAA	2	10	2638	2647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019434	ATT	2	6	2671	2676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019434	TTAT	2	8	2677	2684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019434	A	6	6	2738	2743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019434	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019434	CAATGA	2	12	2789	2800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019434	AG	3	6	2802	2807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019434	A	7	7	2837	2843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019434	A	6	6	2861	2866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019434	AAAT	2	8	2943	2950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019434	A	7	7	2961	2967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019434	GATA	2	8	2983	2990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019434	AGA	2	6	2995	3000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019434	AT	3	6	3005	3010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019434	AGA	2	6	3034	3039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019434	AAT	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019434	A	7	7	3061	3067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019434	AATT	2	8	3154	3161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019434	A	6	6	3166	3171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019434	TAAT	2	8	3184	3191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019434	T	7	7	3191	3197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019434	ACC	2	6	3219	3224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019434	AAAAAT	2	12	3225	3236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019434	AAAAT	2	10	3255	3264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019434	ATT	2	6	3297	3302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019434	GT	3	6	3313	3318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019434	AC	3	6	3319	3324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019434	A	6	6	3769	3774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019434	TTC	2	6	3818	3823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019434	T	6	6	3839	3844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019434	TGA	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019434	ATAA	2	8	3878	3885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019434	TACA	2	8	3926	3933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019434	ATT	2	6	3969	3974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019434	TTA	2	6	4433	4438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019434	ATTTT	2	10	4482	4491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019434	A	8	8	4493	4500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019434	AGA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019434	T	6	6	4624	4629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019434	GTG	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019434	ATT	2	6	4749	4754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019434	TTA	2	6	4873	4878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019434	AAT	2	6	4948	4953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019434	T	7	7	5008	5014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019434	ATTT	2	8	5055	5062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019434	TTA	2	6	5071	5076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019434	A	7	7	5165	5171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019434	A	7	7	5173	5179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019434	TA	5	10	5190	5199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019434	TA	3	6	5207	5212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019434	A	8	8	5238	5245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019434	AAT	2	6	5270	5275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019434	A	6	6	5284	5289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019434	A	6	6	5306	5311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019434	A	6	6	5328	5333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019434	A	6	6	5350	5355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019434	GAA	2	6	5394	5399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019434	TTC	2	6	5418	5423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019434	TCAC	2	8	5438	5445	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.